dr. S. (Sebo) Withoff

Universitair Hoofd-docent

Faculteit Medische Wetenschappen/UMCG

Telefoon:

050 361 7100

050 361 7230 (fax)

Helene Lauvenberg:

E-mail:

s.withoff umcg.nl

Homepage ORCID Research Portal

Speerpunten

Ik onderzoek hoe iemands genetische aanleg (DNA) en niet-coderende RNA moleculen (micro-RNAs (miRNAs) en long non-coding RNAs (lncRNAs)) bijdragen aan de kans op het krijgen van complex genetische, immuun-gemedieerde ziekten zoals Coeliakie, Inflammatoire Darm Ziekte (IBD), Non-alcoholische Steatohepatitis (NASH) en Multipele Sclerose (MS).

Ik gebruik voornamelijk patientenmateriaal en cellijnmodellen als modelsystemen voor ziektes die ik manipuleer en uitlees met de nieuwste 'genomics technologien' zoals bijvoorbeeld CRISPR/Cas9, SNP (single nucleotide polymorphism) arrays, single-cell RNA sequencing, single-cell ATACseq, en oLINK targeted proteomics.

Recentelijk focus ik op de ontwikkeling van organen-op-chip platforms. Hiertoe gebruik ik patientencellen die ik genetisch reprogrammeer tot zogenaamde induced pluriptent stem cells (iPSCs) en die ik op hun beurt differentieer tot darmwandcellen, immuuncellen, bloedvatcellen, of levercellen. De microfluidische darm-op-chip of lever-op-chip systemen die ik vervaardig zijn de meest veelbelovende modelsystemen voor 'personlized medicine' applicaties en onderzoeksvraagstellingen omdat de uitgangscellen zijn verkregen van patienten, wat betekend dat de erfelijke aanleg die aan de basis van de ziekte ligt aanwezig is.

Publicaties

Human organoids and organ-on-chips in coeliac disease research

Simpson, H. L., Smits, E., Moerkens, R., Wijmenga, C., Mooiweer, J., Jonkers, I. H. & Withoff, S., feb.-2025, In: Trends in Molecular Medicine. 31, 2, blz. 117-137 21 blz.

Onderzoeksoutput › peer review

An iPSC-derived small intestine-on-chip with self-organizing epithelial, mesenchymal, and neural cells

Moerkens, R., Mooiweer, J., Ramírez-Sánchez, A. D., Oelen, R., Franke, L., Wijmenga, C., Barrett, R. J., Jonkers, I. H. & Withoff, S., 23-jul.-2024, In: Cell reports. 43, 7, 26 blz., 114247.

Onderzoeksoutput › › peer review

Gene expression and eQTL analysis reflect the heterogeneity in the inflammatory status of the duodenal epithelial lining in coeliac disease

Ramírez-Sánchez, A., Zühlke, S., Aguirre-Gamboa, R., Vochteloo, M., Franke, L., Lundin, K. E. A., Withoff, S. & Jonkers, I. H., 4-mrt.-2024, BioRxiv.

Onderzoeksoutput: Voordruk ›

Genetic mapping across autoimmune diseases reveals shared associations and mechanisms

International Multiple Sclerosis Genetics Consortium, Lincoln, M. R., Connally, N., Axisa, P.-P., Gasperi, C., Mitrovic, M., van Heel, D., Wijmenga, C., Withoff, S., Jonkers, I. H., Padyukov, L., Rich, S. S., Graham, R. R., Gaffney, P. M., Langefeld, C. D., Vyse, T. J., Hafler, D. A., Chun, S., Sunyaev, S. R. & Cotsapas, C., mei-2024, In: Nature genetics. 56, 5, blz. 838-845 8 blz.

Onderzoeksoutput › › peer review

Genome-wide association study identifies novel risk variants for celiac disease in the 5p15.33 locus: insights from a population-based screening of adults, the HUNT

Alam, M. S., Thomas, L. F., Brumpton, B., Hveem, K., Lundin, K. E. A., Withoff, S., Jonkers, I. H., Sollid, L. M., Hjort, R. & Ness-Jensen, E., 12-dec.-2024, MedRxiv.

Onderzoeksoutput: Voordruk ›

High-resolution analysis of the treated coeliac disease microbiome reveals strain-level variation

Slager, J., Simpson, H. L., Gacesa, R., Chen, L., Tan, I. L., Gelderloos, J., Maatman, A., Wijmenga, C., Zhernakova, A., Fu, J., Weersma, R. K., Gonera, G., Jonkers, I. H. & Withoff, S., 21-dec.-2024, BioRxiv.

Onderzoeksoutput: Voordruk ›

Intestine-on-chip enhances nutrient and drug metabolism and maturation of iPSC-derived intestinal epithelial cells relative to organoids and Transwells

Moerkens, R., Mooiweer, J., Smits, E., Berg, M., Ramírez-Sánchez, A. D., Modderman, R., Puschhof, J., Pleguezuelos-Manzano, C., Barrett, R. J., Wijmenga, C., Jonkers, I. H. & Withoff, S., 1-jul.-2024, BioRxiv.

Onderzoeksoutput: Voordruk ›

Potential biomarkers for multiple sclerosis stage from targeted proteomics and microRNA sequencing

Tan, I. L., Modderman, R., Stachurska, A., Almeida, R., de Vries, R., Heersema, D. J., Gacesa, R., Wijmenga, C., Jonkers, I. H., Meilof, J. F. & Withoff, S., 2024, In: Brain Communications. 6, 4, 18 blz., fcae209.

Onderzoeksoutput › › peer review

Standardizing designed and emergent quantitative features in microphysiological systems

Nahon, D. M., Moerkens, R., Aydogmus, H., Lendemeijer, B., Martínez-Silgado, A., Stein, J. M., Dostanić, M., Frimat, J.-P., Gontan, C., de Graaf, M. N. S., Hu, M., Kasi, D. G., Koch, L. S., Le, K. T. T., Lim, S., Middelkamp, H. H. T., Mooiweer, J., Motreuil-Ragot, P., Niggl, E. & Pleguezuelos-Manzano, C.& 13 anderen, Puschhof, J., Revyn, N., Rivera-Arbelaez, J. M., Slager, J., Windt, L. M., Zakharova, M., van Meer, B. J., Orlova, V. V., de Vrij, F. M. S., Withoff, S., Mastrangeli, M., van der Meer, A. D. & Mummery, C. L., 2024, In: Nature biomedical engineering. 8, blz. 941–962 22 blz.

Onderzoeksoutput › peer review

iPSC-derived organ-on-a-chip models for personalized human genetics and pharmacogenomics studies

Palasantzas, V. E. J. M., Tamargo-Rubio, I., Le, K., Slager, J., Wijmenga, C., Jonkers, I. H., Kumar, V., Fu, J. & Withoff, S., apr.-2023, In: Trends in Genetics. 39, 4, blz. 268-284 17 blz.

Onderzoeksoutput › peer review