Wild μ
| Promotie: | Dhr. M. (Marcos) Suarez Menendez |
| Wanneer: | 01 april 2025 |
| Aanvang: | 16:15 |
| Promotors: | P.J. (Per) Palsboll, Prof, B.D.H.K. (Britas Klemens) Eriksson, Prof, prof. dr. R.S. (Rampal) Etienne |
| Waar: | Academiegebouw RUG |
| Faculteit: | Science and Engineering |
Mutatiesnelheid: schattingen, uitdagingen en toepassingen
Mutaties zijn de motor van evolutie, waardoor schattingen van de mutatiesnelheid μ essentieel zijn voor het begrijpen van evolutionaire processen en een cruciale parameter in de populatiegenetica. De meeste μ-schattingen worden afgeleid uit het aantal waargenomen veranderingen in homologe DNA-sequenties in fylogenieën met bekende divergentietijden. Deze methode brengt echter verschillende bronnen van fouten en onzekerheden met zich mee. Directe μ-schattingen, die minder onzekerheden hebben, vereisen uitgebreide stamboomgegevens en zijn grotendeels toegepast op model- of in gevangenschap levende soorten, waardoor wilde organismen beperkt blijven tot fylogenetische schattingen.
Baleinwalvissen behoren tot de grootste en langstlevende zoogdieren, waardoor ze ideale onderwerpen zijn voor μ-onderzoek. Hun wereldwijde verspreiding en grote migraties bemoeilijken echter de gegevensverzameling. In dit proefschrift ontwikkelde en testte Marcos Suarez Menendes bio-informatica en moleculaire tools om de benodigde gegevens te verkrijgen, van de ontdekking van heteroplasmie tot genetisch gebaseerde ouderdomsinferentie, voor directe schattingen van nucleaire en mitochondriale μ in verschillende baleinwalvissoorten .
De resulterende μ-schattingen werden gebruikt om eerdere debatten over fylogenetische μ-schattingen te betwisten, van het verklaren van lage kankerpercentages bij walvissen tot de berekening van pre-jacht populatiegroottes.
Voor wilde organismen met niet-standaard levenscycli, zoals diatomeeën, zijn de uitdagingen nog groter, en μ-schattingen ontbreken vaak ondanks hun ecologische rol. Deze thesis onderzocht de schatting van μ en de toepassing ervan in demografische analyses, en benadrukte het belang van verder onderzoek. Dit proefschrift toont de haalbaarheid van directe μ-schattingen in wilde en moeilijk te bestuderen soorten en de brede impact ervan op ecologisch en evolutionair onderzoek.