sRNA regulation in Lactococcus lactis

CRISPRi-platforms waardevolle aanvulling op genetische gereedschapskist

Meishan Liu bouwde CRISPR-interferentieplatforms (CRISPRi) voor Lactococcus lactis. De CRISPRi-platforms zullen een waardevolle aanvulling zijn op de genetische gereedschapskist voor genbewerking in L. lactis.

Liu: 'Lactococcus lactis is een veelgebruikte bacterie in de industrie van gefermenteerde zuivelproducten. Tijdens industriële processen krijgen de bacteriën vaak te maken met verschillende omgevingsstress. Het onderzoek naar regulatie op RNA-niveau in L. lactis is daarom belangrijk, omdat transcriptionele en post-transcriptionele regulatie voordelen bieden in precisie, flexibiliteit en snelle reactie op veranderingen in de omgeving.

In dit proefschrift bouwden we CRISPR-interferentieplatforms (CRISPRi) voor L. lactis. De CRISPRi-platforms zullen een waardevolle aanvulling zijn op de genetische gereedschapskist voor genbewerking in L. lactis.

We hebben ook de functionele rollen van twee sRNA's van L. lactis onderzocht. Ons onderzoek toonde aan dat sRNA ZnsQ betrokken is bij de opname van Zn(II)-ionen om zinkvergiftiging te voorkomen en een snelle start biedt zodra Zn(II) limiterend wordt. Van het andere sRNA S092 is aangetoond dat het deelneemt aan het koolstofmetabolisme, vooral bij het gebruik van fructose. Overexpressie van S092 veroorzaakt ook een stressrespons op de celschil. Daarnaast hebben we een eerste verkenning uitgevoerd van het eiwit RapZ, dat sRNA's bindt in L. lactis, waarbij we hebben laten zien dat het betrokken kan zijn bij de regulatie van het argininemetabolisme, waaraan sRNA ArgX deelneemt.

Ons onderzoek levert een waardevolle bijdrage aan het veld en zal de wetenschappelijke kennis over sRNA-regulatie in L. lactis bevorderen. Als we deze sRNA-gemedieerde regulatiemechanismen beter begrijpen, kan metabolic engineering worden toegepast om het aanpassingsvermogen van stammen aan stress te verbeteren en/of de bioproductiecapaciteiten van stammen te verbeteren, met name voor industriële toepassingen van L. lactis.'

Proefschrift: https://hdl.handle.net/11370/6699ecec-4a47-491d-aa23-1ff43eb1b33d